Rad common rail injektora može se podijeliti u sljedeće faze:
Faza punjenja: Gorivo pod visokim-pritiskom teče iz common rail-a u kontrolnu komoru injektora, gurajući igličasti ventil prema gore i komprimirajući povratnu oprugu; u ovom trenutku otvori mlaznica ostaju zatvoreni.
Faza pre{0}}ubrizgavanja: ECU emituje kratak impulsni signal, pokrećući elektromagnetni ventil. Gorivo u kontrolnoj komori se smanjuje protokom kroz povratni prolaz, uzrokujući da se igličasti ventil brzo spušta pod silom povratne opruge. Mala količina goriva (otprilike 1-3 mm³) se ubrizgava u cilindar tokom vrlo kratkog vremena (0,1-0,3 ms), stvarajući "pilot paljenje" koje pred-zagrijava cilindar i uspostavlja povoljne uslove za glavno ubrizgavanje.
Faza glavnog ubrizgavanja: ECU produžava trajanje napajanja elektromagnetnog ventila, uzrokujući da pritisak u kontrolnoj komori i dalje pada. Igličasti ventil se potpuno otvara i velika količina goriva (u rasponu od desetina do stotina mm³, ovisno o radnim uvjetima) se ubrizgava u cilindar pod visokim tlakom (preko 200 MPa), formirajući jednoliko raspršeni raspršivač goriva koji se temeljito miješa sa zrakom za izgaranje.
Faza nakon-ubrizgavanja: Nakon završetka glavnog ubrizgavanja, ECU emituje još jedan kratki impulsni signal da izvrši odloženo ubrizgavanje male količine goriva. Ovo služi za smanjenje temperature izduvnih gasova (npr. za EGR sisteme) ili za olakšavanje oksidacije čestica (npr. za regeneraciju DPF-a).
